卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变。月经期脱落的子宫内膜碎片，随经血逆流经输卵管进入盆腔，种植在卵巢表面，形成异位囊肿，这种异位的子宫内膜也受性激素的影响，随同月经周期反复脱落出血，而无法排出体外，使卵巢增大，形成内含陈旧性积血的囊肿，这种陈旧性血呈褐色，粘稠如糊状，似巧克力，因此称为巧克力囊肿。可出现痛经、持续性下腹疼痛、月经失调、不孕和性交痛等病症。(指导阅读：卵巢良性恶性病变的治疗)